究院成立60周年暨常书鸿先生诞辰100周年纪念活动”“2004年石窟研究国际学术讨论会”
组织和筹备。专著《敦煌石窟全集》第四卷《佛传故事画卷》由香港商务印书馆出版。编著《敦煌石窟》由旅游出版社出版。撰文《为
敦煌久远长存——敦煌石窟保护探索》，刊于《人民政协报》。参加2004年全国文物外事工作会议，发表论文《面向未来，国际合作保护迈上新台阶》。主持完成由国家文物局委托、8个科研单位联合攻关《国家文化遗产保护中长期科学和技术发展规划研究》课题。接受中央电视台《正大综艺》栏目《守望敦煌》、《面对面》和《东方之子》栏目专辑拍摄，协助中央电视台成功直播《敦煌再发现》大型节目。
2005年被国务院授予“全国先进工作者”荣誉称号。在上海和北京主持召开“敦煌莫高窟保护利用设施项目数字展示技术验证专家论证会”，组织开展《莫高窟保护利用项目管理系统可行性研究》。主持完成“古代壁画保护国家文物局重点科研基地”机构设置和组建，于2005年11月30日正式挂牌。完成《敦煌石窟全集》（专题分类全集）26卷编辑出版。参加2005年国际古迹遗址理事会（ICOMOS）亚洲区域性讨论会，发表论文《莫高窟保护与旅游矛盾及对策》。参加“国际古迹遗址理事会（ICOMOS）第十五届大会”，做题为《按照〈准则〉原则制定〈敦煌莫高窟保护总体规划〉》专题发言。主持完成《敦煌石窟保护与利用研究》《全数字摄影测量技术在莫高窟文物保护中应用研究》课题。
2006年参与安排部署敦煌研究院与兰州大学、美国盖蒂保护研究所、英国伦敦大学考陶尔德艺术学院联合开办壁画保护研究生班以及教学工作。为配合敦煌莫高窟保护利用设施项目可行性研究，赴美国考察博物馆数字展示技术以及游客组织、管理和服务措施。参加“世界遗产地旅游可持续发展规划与管理国际研讨会”，做题为《加强旅游管理，让莫高窟为人类做出更大贡献》主题发言。与赵声良合写《灿烂佛宫》由浙江文艺出版社出版。与中央电视台合作拍摄大型纪录片《敦煌》；与日本铁木真电视公司合作制作专题片《中国石窟鉴赏——敦煌莫高窟》；协助完成中央电视台《探索发现》栏目组《守护莫高窟》、德国电视二台《穿越新疆》节目、韩国MBC电视台《黄河》节目。
2007年被聘为中央文史研究馆馆员。获得甘肃省“三八红旗手”和“全省各级领导干部作风建设先进个人”荣誉称号。主持举办“纪念段文杰先生从事敦煌文物和艺术保护研究60年”和“敦
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